確定申告の後に税務調査が来る人の特徴と個人事業主の備え方

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確定申告の後に税務調査は来る？まず知っておきたいこと

数字を見ると、自宅や事務所に来る実地調査より、文書や電話での確認のほうがずっと多いんです。

実は、税務署からの連絡には「調査」と「行政指導」の2種類があります。国税庁の「税務調査手続に関するFAQ」で、両者は分けて説明されています。

税務署の担当者は、手続に入る前に調査か行政指導かを納税者に明示することになっています。電話が来たら「これは調査ですか」と聞いてみてください。

例えば、こんな電話です。

「申告書の経費の欄の計算が合わないようなので、見直していただけますか」
「分かりました。確認して、必要なら修正申告を出します」

この段階で自主的に直せば、過少申告加算税はかかりません。早めに対応するのが得なんです。

税務調査が来やすいと言われる個人事業主の特徴

『どんな人が調査されるの？』というのは、真っ先に気になるところですよね。

調査先の選び方は公表されていません。ここでは、一般によく言われる特徴と、その理由を挙げておきます。当てはまるから調査が来る、という意味ではありません。

ネットショップや副業など、取引先から支払調書や売上の記録が税務署に出ているケースもあります。申告した数字と合っているか、見直しておくと安心です。

例えば、年商800万円でネットショップを営む個人事業主のケースです。モールの売上管理画面の合計と、帳簿の売上が合っているかを毎月見ておくだけでも、申告の誤りはかなり防げます。

手数料や送料を差し引いた入金額だけを売上にしていると、売上が少なく見えることもあります。売上と経費をそれぞれ計上しているか、一度確かめておきましょう。

申告をしていない年がある方は、無申告で税務調査が来る前に期限後申告する手順も読んでみてください。

商工会議所で確定申告をした場合は調査されにくい？

『商工会議所で申告書を見てもらったから、調査は来ないよね』と考える方もいるはずです。

商工会議所や商工会で記帳や申告の相談を受けたかどうかで、調査の対象から外れるという公的な情報は見当たりません。申告書を誰が作ったかより、中身と帳簿がそろっているかが問われます。

税理士が申告書を作る場合は、「書面添付制度」という仕組みがあります。税理士が作った書面を添付すると、調査の通知の前に税理士が意見を述べる機会が設けられます。

ただ、国税庁はこの制度について、調査の省略を前提としたものではないと明記しています。調査が無くなる仕組みではないので、そこは誤解しないでおきましょう。

大切なのは、誰に見てもらったかより、申告書の数字を自分で説明できるかどうかです。帳簿の付け方に不安があれば、相談先を早めに決めておくと落ち着いて申告できます。

個人事業主が今からできる備え

ここが大事なところです。調査が来るかどうかは選べませんが、来た時の負担は今から減らせます。

修正申告のタイミングで、過少申告加算税の割合が変わります。

所得税の確定申告の期限は、原則として翌年3月15日です。令和8年分は令和9年3月15日（月）が期限になります。

反対に、税金を納めすぎていた時は、原則として法定申告期限から5年以内なら更正の請求ができます。

調査の通知が来た後の進み方は、税務調査の対応の流れで確認できます。修正申告を勧められた時の考え方は修正申告を求められた時に確認することにまとめています。

売上が伸びて帳簿付けが追いつかない、経費の判断に毎年迷っている。そんな状況なら、顧問税理士に記帳から申告まで見てもらうと、調査への不安もぐっと減ります。

よくある質問

まとめ

この記事は国税庁の税務調査手続に関するFAQ（一般納税者向け）と令和6事務年度 所得税及び消費税調査等の状況をもとに書いています。個別の判断は税理士に確認してみてください。

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